骨腫瘤種類很多，不同骨腫瘤其好發部位也不相同，有些腫瘤位於四肢骨幹，有些腫瘤位於關節附近，比如骨瘤、骨軟骨瘤；血管瘤多發生於頭顱骨；骨樣骨瘤多位於小腿骨；內生軟骨瘤多見於軟骨。一般原發性骨腫瘤好發於四肢長骨，如常見的骨肉瘤、尤文氏肉瘤、惡性骨鉅細胞瘤，大多發生在膝關節周圍及股骨下端或者脛骨上端。脊柱腫瘤中最常見的脊索瘤常常發生於骶骨。骨髓瘤因為是一種血液系統來源的腫瘤，多發生於中樞骨，例如顱骨、脊柱。轉移性骨腫瘤大多見於中樞骨，比如骨盆、脊柱或者股骨。由於骨腫瘤發生部位不同，臨床發現腫瘤後，可以大體上做個判斷。