秋季腹瀉的治療以對症支持治療為主，主要有以下幾種方法：

1、補充水、電解質：需判斷患者是否存在脫水症狀，脫水典型表現如口渴、口乾、口唇乾燥、皮膚乾燥等，嚴重時可能出現眼窩凹陷，孩子則可能出現精神萎靡、囟門凹陷等情況。若較輕微，可通過口服補液鹽，進行家庭支持治療，同時飲食清淡，注意正常進食奶製品，或添加輔食等。若脫水症狀較明顯，病人、患兒精神萎靡，此時需及時進行靜脈輸液治療，以糾正水、電解質失衡的情況；

2、對症止瀉治療：止瀉可通過蒙脫石散進行，蒙脫石散不僅可起到止瀉作用，也可以起到保護腸黏膜作用，同時可補充益生菌進行如雙歧桿菌、三聯活菌，培菲康(雙歧桿菌三聯活菌散)、媽咪愛(枯草桿菌二聯活菌)等，調節腸道菌群失調的情況；

3、防止交叉感染：若合併細菌感染，應及時進行鑑別與進行治療，可能需使用抗生素，如頭孢三代，進行抗感染治療。