土黴素目前已不作為腹瀉常規治療標準藥，而為獸用藥物，所以不推薦土黴素治療腹瀉。腹瀉不一定都為感染性，土黴素屬於抗菌素，使用抗菌素需有嚴格指徵。大部分患者認為腹瀉時應消炎藥、抗菌素，此觀點屬於明顯誤區，需要更正。

腹瀉多為病毒性，還可為功能性，甚至部分因功能性消化不良引起，此時使用抗菌素會引起耐藥細菌增加，還會破壞正常腸道菌群。正常菌群對於人體有較重要的保護性機制，正常菌群遭到破壞時腸道較易遭受打擊，正常菌群存在時不易感染致病菌患病。所以使用大量抗生素後會導致人體發生機會性感染，常見的難辨梭菌感染越服用抗生素，腹瀉會越嚴重，可出現腸道炎症。腹瀉時不能亂用抗生素，需至醫院在醫生指導下使用。