生理性腹瀉的特點通常為大便次數一直較多，大便的性狀也一直稀薄。但嬰兒其它方面均沒有問題，精神狀態特別好，無腹痛等這些情況。另外，嬰兒通常吃得多、拉得多，但體重發育正常，這種情況通常為生理性腹瀉。病理性腹瀉主要突然出現的腹瀉，比如嬰兒之前大便不多，突然間明顯的大便次數增加，而且大便變稀，甚至出現膿血。這種情況下首先給嬰兒化驗大便，排除感染性腹瀉。

另外，部分嬰兒長期腹瀉，而且表現特別明顯，一吃奶就腹瀉，腸鳴音亢進，經常放屁，而且大便可能會出現泡沫、酸臭這種情況，則可能為乳糖不耐受導致。若為乳糖不耐受引起的腹瀉，需給嬰兒服用乳糖酶來幫助消化母乳裡的乳糖，對於奶粉餵養的乳糖不耐受的嬰兒，可將奶粉換成不含乳糖的腹瀉奶粉。排除病理性腹瀉以後，常見的為生理性腹瀉。