氟哌啶醇可抗多巴胺，也可抗膽鹼受體，還可阻斷α受體，根據藥理作用能看出，其不良反應中錐體外系反應較重而且常見。氟哌啶醇不良反應如下：

1、急性肌張力障礙，在兒童和青少年中易發生，會出現明顯扭轉痙攣甚至吞嚥困難或靜坐不能；

2、遲發性運動障礙，如會有運動遲緩，僵直、震顫症狀出現，應是長期大量使用才會出現遲發性運動障礙；

3、可出現口乾、視物模糊、乏力、便秘、出汗；

4、月經失調、閉經、溢乳，因還可引起血漿泌乳素濃度增加甚至男性患有男性乳房發育症；

5、長期大量使用可出現抑鬱反應；

6、心律失常，因為藥物可引起QT間期延長，QT間期延長類似心律失常；

7、出現直立性的低血壓。如同時服用氟哌啶醇因藥物可作用於α受體，因此在服用藥物時動作應緩慢。