抑鬱症病因尚不明確，目前比較一致的觀點是多因素的疾病，與遺傳相關。抑鬱症呈家族聚集性，即家族中如果有人患有抑鬱症，後代患病風險比其他家族高，而且並非單基因遺傳病，後代不確定是否患有疾病。

抑鬱症除遺傳因素以外，還與其他因素有關，比如腦結構與功能，腦神經生物學代謝，以及環境因素，如童年成長經歷、不良事件，挫折和創傷，以及成人後慢性壓力、重大打擊等，上述因素共同參與抑鬱的發生。抑鬱是多因素疾病，屬於基因與環境交互的結果。