如果一旦出現可疑的小腦腦幹腦梗，要及時就診，要求3小時之內溶栓，病人能夠得到獲益，最晚4.5小時之內必須進行，這種情況有鑑別診斷，即有些可以溶栓治療，有些患者不可以進行溶栓，溶栓可以讓血管儘快再通，是臨床治療的關鍵。隨後在6個小時之內，如果病人是大面積梗死、預後很差，可以嘗試進行動脈拉栓，後循環動脈拉栓效果不如前循環動脈拉栓好。

如果病人危重，可在隨後24小時之後，進行雙抗治療，雙抗就是使用兩種抗血小板聚集的藥物進行治療，如阿司匹林、氯吡格雷合用。同時加大量的高劑量他汀，抑制炎症反應，產生抗脂作用，為治療的核心。在治療期間保證血壓的穩定性，即血壓不能太高，但是也不能太低，保持1高壓在130-140mmHg，低壓在70-80mmHg。同時在急性期，建議病人平臥休息，保證早期病人病情的穩定，不要出現明顯的波動，因為在起坐過程中，由於血液動力學改變，容易使病情發生波動。待病情穩定後再進行活動，同時強調在生命體徵平穩的情況下，早期進行積極的康復鍛鍊，以保證病人良好的預後。