牙周炎大部分屬於慢性疾病，發病的根本原因是牙石，還有附著在牙石上的細菌以及毒素。不應該使用抗生素治療牙周炎。因為抗生素不能從根本清除致病因素，即牙石、細菌以及毒素，甚至可能掩蓋症狀，誤以為牙周炎已經治癒，不需要進一步治療，最終延誤整個治療的過程。牙周炎強調學會有效的控制菌斑，保持良好的口腔衛生，定期洗牙，必要的時候進行牙周的基礎治療。所有的目的是為了去除牙石、細菌、菌斑等局部的刺激因素。並不是所有的牙周疾病都不需要吃藥，對於某些急性的牙周疾病，比如急性牙周膿腫、急性齦乳頭炎，為了快速控制急性炎症，可以在局部治療的同時輔助使用抗生素，必要的時候也可以聯合用藥，但是，最終要遵循循證醫學的原則，合理的使用藥物。牙周炎的治療強調以局部治療為主，全身用藥起輔助的作用。