重症肌無力是自身免疫疾病，重症肌無力通常是神經、肌肉接頭傳遞功能障礙引起，屬於一種獲得性自身免疫性疾病。

一般認為該病的病因是在病毒感染以後機體產生相應抗體，這種抗體在胸腺上也存在類似抗原，通過抗原模擬機制，抗體開始攻擊人體神經肌肉接頭突觸後膜上的乙酰膽鹼受體，引起一系列臨床症狀，目前發現越來越多其它部位的抗體也和重症肌無力有關。所以，重症肌無力是一種自身免疫性疾病，而且屬於後天獲得性自身免疫性疾病。