重症肌無力是可治療性疾病，但不是所有重症肌無力患者通過服用藥物即可治癒。一旦確診為重症肌無力，及時給予患者口服藥物治療可以達到早期控制、早期治癒。藥物通常選擇膽鹼酯酶抑制劑、免疫抑制劑、中藥等，但可以使用的藥物有很多，不同患者的用藥要有選擇性，科學用藥十分關鍵。比如膽鹼酯酶抑制劑僅僅是改善症狀的藥物，作用時間為4-6小時。而對於重症肌無力的免疫本質並沒有治療作用。因此如果僅服用膽鹼酯酶抑制劑，則肯定無法將其治癒。並且免疫抑制劑有6-7種，選哪種藥物能將其治癒是不一定的，而不同中醫辨證論治用藥也不一樣。

如果是進展性重症肌無力、危象期重症肌無力，單純口服藥物以及無法阻止患者的病情惡化，此時需要住院應用多種方法進行綜合治療。靜脈注射免疫球蛋白和血漿置換適用於危象期病情加重時的短程治療，也適用於重症肌無力患者手術前的準備用藥。對於有胸腺瘤的重症肌無力患者，一經確診，則應該進行手術治療將其切除，為選擇性治療措施。而對於口服藥物治療無效、反覆發作，年齡介於15-60歲乙酰膽鹼受體抗體陽性的重症肌無力患者，可以選擇胸腺切除治療。