重症肌無力的治療目前主要包括藥物治療和手術治療，一種方法可能難以將該病徹底治好。對於重症肌無力的病人首選藥物治療，比如嗅吡斯的明、激素、免疫抑制劑。胸腺切除是治療重症肌無力的有效治療方法之一。由於重症肌無力是一種自身免疫性疾病，自身免疫重要源頭之一就是胸腺。目前的研究已經證明，通過手術切除胸腺，可以改善重症肌無力的症狀。對於部分病人，尤其是症狀比較輕的病人，比如單純眼肌型病人的改善可能會很明顯，甚至能達到治癒。重症肌無力主要採用綜合治療，手術是很重要的治療手段之一，但是手術並非該病唯一的治癒手段。