重症肌無力鑑別診斷如下：

1、眼肌型肌無力：肌無力主要集中於眼部肌肉，需與導致眼部肌肉麻痺的疾病相鑑別，如動眼神經麻痺、糖尿病、感染、老年性眼瞼下垂，通過影像學檢查、化驗檢查相鑑別；

2、全身型肌無力：主要與肌無力綜合徵相鑑別，肌無力綜合徵常繼發於肺部腫瘤。另外，部分肌肉病也可表現為全身肌無力，通過基因檢測、肌電圖檢測、檢驗或影像學檢查可鑑別。