重症肌無力患者經專業醫生指導，進行系統科學治療，多數患者可得到緩解及治癒，但少數重型全身型患者，因併發症問題，如併發呼吸衰竭、肺感染、全身併發症，甚至出現感染中毒性休克，需搶救治療，部分患者出現吞嚥、呼吸肌無力或嗆食，需特別注意。總體而言，多數患者預後較好，少數重症患者，如為癌性肌無力，患者預後相對較差。