病毒性腦膜炎患兒的腦脊液檢查可以出現正常範圍值，臨床上會有腦炎表現，會有發燒、腦膜刺激徵、噴射性嘔吐、頸強直等腦膜炎改變。腦脊液中，白細胞中性分類較高，晚期淋巴細胞稍高，但壓力、蛋白質含量、白細胞含量可以正常或稍高。

病毒性腦膜炎患兒的腦脊液檢查，傾向於沒有特異性，明確出現特殊變異指標，此類化驗結果指向病毒性腦膜炎。細菌性腦膜炎，會有明顯的白細胞增高現象，腦脊液檢查，對於不同病原菌造成的神經系統感染比較有意義。