預防隱球菌腦膜炎和預防其它的腦膜炎相似，主要的預防措施如下：

1、增強抵抗力：隱球菌在大氣中、空氣中、土壤裡存在，是條件致病菌。吸入隱球菌後，人體的免疫力強大時能將隱球菌清除，但是免疫力低下時，吸入隱球菌就可能造成肺部的隱球菌感染，然後再通過血液到達腦部，引起隱球菌腦膜炎，所以預防隱球菌腦膜炎需要增強人的抵抗力；

2、減少隱球菌的吸入：禽類的糞便中隱球菌含量很高，潮溼的不通風空氣中隱球菌含量高，如果需要在這種環境中工作、生活，就要積極地戴口罩，以減少隱球菌的吸入。

很多隱球菌的病人患病前，都有勞累、工作很壓力很大、經常熬夜、生活不規律等降低抵抗力的生活習慣，從而 導致隱球菌的感染髮病。有基礎病的人群，如有惡性腫瘤、糖尿病或者有免疫疾病的病人，本身抵抗力就很差的情況下，也非常容易感染隱球菌腦膜炎。