多數情況下，腦膜炎的治療至少需要2-3周的時間。腦膜炎治療的具體時間取決於新生兒的病情，部分新生兒的症狀比較輕，只是做常規檢查時發現有腦膜炎，同時無其他症狀，此時治療時間相對要短。但有些新生兒的症狀可能較嚴重，出現全身的感染中毒症狀，再加精神狀態的異常，如異常的嗜睡或異常煩躁，甚至出現抽風、驚厥等情況，提示病情比較嚴重，此時治療的時間相對也比較長。

此外新生兒因為血-腦屏障功能發育的還不是很完善，所以當新生兒有全身感染時，血中的細菌非常容易通過血-腦屏障進入腦部，造成腦膜炎。新生兒出現腦膜炎還是相對比較嚴重的疾病，所以家長要對此重視，積極的配合醫生的治療。一般治療效果與新生兒感染細菌的毒力、自身的抵抗力以及所使用的藥物有關，所以家長要有耐心，積極配合治療。