結核性腦膜炎有可能治癒，但結核性腦膜炎的治療比較困難。結核性腦膜炎需要使用抗癆藥物，給予足量、足療程的治療。治療結核桿菌的異煙肼、利福平等藥物，對於結核性腦炎容易發生耐藥，藥物也會有不良反應等，增加治療結核性腦膜炎的困難。

結核性腦膜炎患者的死亡率較高，可能有55%-75%的患者會有比較不良的預後。發現結核性腦膜炎的情況下需要早期、足量、足療程的抗癆治療，通過綜合性方案更好改善患者預後。結核性腦膜炎也會有併發症，比如腦積水、高鈉血癥、多顱神經損傷等。