腦膜炎泛指各種原因引起軟腦膜的瀰漫性炎症改變，大部分的腦膜炎患者如果治療及時，通常預後較好。少數患者可能會留有某些後遺症，具體如下：

1、智力下降嚴重：病毒性腦膜炎、化膿性腦膜炎和細菌性腦膜炎，可以對腦部造成器質性損傷，從而出現此情況。大多數屬於輕微智力下降，在治癒後會緩慢恢復，通常需要1-3年。嚴重者可能會終身智力低下，對人生造成嚴重影響；

2、腦積水：患腦膜炎可引起腦脊液的循環障礙，產生腦積水。常見於治療不當或治療過晚的病人，尤其多見於新生兒和年齡較小的嬰兒出現腦膜粘連、腦脊液循環障礙，從而導致此症狀；

3、語言理解和表達能力喪失：顱神經受損、麻痺，如耳聾、視力障礙、斜視、面神經癱瘓等；

4、癲癇：由於腦實質損害及粘連，可使顱神經受累，因此腦膜炎會引起癲癇，腦膜炎後遺症也會導致癲癇的出現。有些患者不會在短期內發生，會在數年出現，表現為運動、感覺、意識、植物神經、精神等不同障礙，臨床表現為突然的意識喪失、跌倒、四肢抽搐、口頭白沫，但是醒後如正常人。