真菌性腦膜炎是指真菌感染到腦膜以後，引起中樞神經系統感染，有時可繼續累及腦實質，引起真菌性腦膜腦炎，本病確診的方法如下：

1、進行神經科的專科查體：真菌腦膜炎的症狀可以表現為感染徵象，包括髮熱、頭痛、噁心、嘔吐，在查體時可以看到頸項強直、克氏徵陽性等腦膜刺激徵的情況。如果病變累及到腦實質，可以出現局灶性神經功能缺損的表現，比如肢體癱瘓、顱底改變、視物模糊、面神經癱瘓、三叉神經痛、者面癱及耳鳴、眩暈、聽力下降等，通過相應的神經科專科查體，可以發現一些異常；

2、影像學的檢查：如磁共振，可以發現腦膜強化、腦水腫、腦積水的情況，或者發現局灶性的病灶；

3、腰穿腦脊液進行化驗：對隱球菌墨染色或隱球菌的真菌培養，以達到確診目的；

4、隱球菌莢膜抗原檢測：目前也可以根據隱球菌莢膜抗原檢測結果來判斷，如果抗體陽性，也可確診為真菌性腦膜炎。