真菌性腦膜炎或真菌性腦膜腦炎，均屬於嚴重的中樞神經系統感染性疾病，大部分患者的預後均不是很好。真菌性腦膜炎，是由於真菌感染腦膜後，引起的中樞神經系統的感染。主要發生於免疫力低下的患者。在近幾年，本病的發病率有逐漸上升的趨勢，這是因為糖尿病的患者、器官移植、艾滋病的患者、大劑量服用激素或免疫抑制劑的患者，以及免疫力低下的患者越來越多，繼發出現真菌感染的問題。

如果是早期的真菌感染，治療比較及時，則可取得比較好的效果。但是由於真菌感染的個體不同，基礎疾病不同，其預後也是不一樣的。大部分的真菌性腦膜炎患者，由於基礎疾病比較重或者合併有免疫力低下的問題，所以病情也比較重。比如患者伴有糖尿病或者腫瘤，或者長期運用激素和免疫抑制劑治療，則在對基礎疾病進行治療外，還要進行抗真菌的治療。而抗真菌藥物本身又有一定的毒副作用，藥物對機體會造成一定損傷。如果是大劑量、長療程進行抗真菌治療，有些人可能繼發二重，甚至三重的感染。比如結核或者弓體蟲，會加重疾病本身的進展。對於這一類的患者來說，其預後就比較差。