通過檢查明確視神經脊髓炎譜系疾病後，急性期需給予激素衝擊治療，而疾病修正治療常選用免疫抑制劑，避免患者再次復發。部分情況下可能找不到相對特異性抗體，所以無法歸類到視神經脊髓炎譜系疾病，但考慮其既往存在感染，可有免疫相關性，所以在急性期治療也可選擇激素。

沒有明確證據時，後續激素口服需逐漸減量，但沒有證據添加相關免疫抑制劑治療。橫貫性脊髓炎的損傷較重，需注意併發症處理，包括壓瘡、尿便功能障礙、泌尿系統感染等。橫貫性脊髓炎不是疾病名稱，通常是對脊髓損傷程度的界定，包括對相關功能的影響，如肢體力量、感覺、尿便功能。臨床常見視神經脊髓炎譜系疾病可造成橫貫性脊髓損傷，繼發於病毒感染的免疫反應可造成免疫相關脊髓損傷。