未經治療的病毒性腦炎較難完全自愈，甚至可能出現死亡。病毒性腦炎是由於病毒侵犯中樞神經系統所引起的疾病，預後取決於疾病嚴重程度以及治療是否及時。若疾病發現較早，給予及時抗病毒治療，則患者預後較好。

若患者發作時症狀較為嚴重，且治療不及時，病毒性腦炎的死亡率可達到60%左右，10%的患者會遺留不同程度的後遺症。因此病毒性腦炎預後主要取決於病情嚴重程度以及治療是否及時，臨床出現病毒性腦炎症狀需儘早就醫，到醫院進行診斷以及規範化治療，避免耽誤病情。