兒童閉塞性細支氣管炎的病因常見於感染，感染之中最常見病原是腺病毒，其次包括呼吸道合胞病毒、流感病毒、副流感病毒、支原體、衣原體以及百日咳等等，都會導致閉塞性細支氣管炎的發生。另外對於結締組織疾病，其中具有重症的多形性滲出性紅斑、硬皮病、類風溼性關節炎等等，亦可能會導致閉塞性細支氣管炎疾病。其它與移植相關的抗宿主排斥反應可以導致閉塞性細支氣管炎。部分孩子還可能與胃食道反流相關。雖然以上致病因素較多，但是在臨床上仍有小部分孩子無法找到明確病因。