小兒支氣管炎消炎藥的選擇，主要根據呼吸道感染，常見細菌的敏感性選擇。最常用的有大環內酯類藥物，如阿奇黴素、環酯紅黴素，可以覆蓋常見的肺炎鏈球菌、支原體等呼吸道感染的細菌。治療較困難的患者，如用阿奇黴素、紅黴素效果不好，也可以選擇頭孢類或青黴素類的抗菌素。

頭孢類抗菌素和青黴素類抗菌素，部分小兒在使用時會出現過敏症狀。若第一次服用，要注意詢問是否有這類藥物過敏的情況，對這類藥物過敏的人群不能服用。另外在抗感染的同時，也需要清肺化痰，才能儘快控制住支氣管炎，恢復正常情況。