肺纖維化主要的併發症是缺氧，缺氧嚴重影響患者的身體健康。會導致患者肺動脈的高壓、血管床面積的減少、下肢腫、呼吸困難、血流速度減慢、心率增快、頭疼等，缺氧嚴重甚至引起肺源性心臟病、腦梗塞、心肌梗塞、胃腸道的反應、肝功能異常、轉氨酶升高、腎功能障礙以及皮膚的變化等。此外，肺纖維化患者較正常人容易發生肺部感染。