橋本氏甲狀腺炎需要根據甲狀腺功能、甲狀腺抗體、B超及臨床症狀幾方面綜合確診。橋本氏病抗甲狀腺抗體，如過氧化物酶抗體、甲狀腺球蛋白抗體均較高，為診斷橋本氏病的重要指標和依據。大部分患者B超檢查可發現甲狀腺腫大、質地較硬、瀰漫性回聲不均或伴甲狀腺結節。

部分橋本氏甲狀腺炎患者會出現甲減，即T3、T4低、TSH高，部分患者也可出現甲亢表現，即T3、T4高而TSH低，部分患者甲狀腺功能正常。