如果橋本甲狀腺炎患者的甲狀腺功能正常，一般不需要藥物治療。當患者發生亞臨床或臨床甲狀腺功能減退時，則需要通過補充甲狀腺激素治療。近年來臨床研究發現，補充硒製劑可以使甲狀腺過氧化物酶抗體滴度下降，從而改善橋本甲狀腺炎病人健康相關生活質量，但是硒試劑的安全劑量、治療持續時間尚不確定。
橋本甲狀腺炎是自身免疫性甲狀腺疾病中最常見的類型，也是甲狀腺功能減退症和甲狀腺腫大最常見的原因。橋本甲狀腺炎佔甲狀腺疾病的22.5%左右，在各年齡段都可以發病，嬰幼兒期也可以出現，女性患者是男性患者的5-10倍，並且隨著年齡的增長，發病率逐漸增加，發病高峰年齡是45-65歲。
橋本甲狀腺炎在病理上表現為淋巴細胞浸潤腺體後，甲狀腺組織逐漸萎縮，當疾病進展到一定程度，會導致甲狀腺功能減退。由於受損的甲狀腺實質的範圍不同，橋本甲狀腺炎患者可以表現為甲狀腺功能減退或亞臨床甲狀腺功能減退，其中亞臨床甲減佔多數。在發生甲減以前，患者可以沒有任何症狀，發生甲減以後可以表現為便秘、易疲勞、皮膚乾燥、畏寒、體重增加、記憶力減退、水腫等。目前橋本甲狀腺炎的發病基質尚未十分明確，遺傳因素和免疫因素在橋本甲狀腺炎的發病中都起到重要作用，此外還與碘、硒的攝入水平、性別等因素有關。