早期腸癌的5年生存率可以達到90%，即早期腸癌的預後較好，5年生存率90%意味著100個早期腸癌患者，有90個可以活過5年。早期腸癌的臨床分期應該屬於Ⅰ期腸癌，就是腫瘤侵犯到黏膜、黏膜下層，而沒有局部區域淋巴結轉移，也沒有遠處轉移。在腸癌最常見的TNM分期中，屬於T1-T2、N0、M0。

目前為止，大多數早期腸癌均能得到臨床治癒，還能長期生存，所以腸癌的預後與臨床分期密切相關。早期腸癌5年生存率90%，但是到進展期腸癌5年生存率，通常只有50%-70%。所以腸癌診斷越早，經過及時治療預後越好。經過正規治療，早期腸癌通常均能夠長期生存，獲得臨床治癒。