大部分結直腸腫瘤和遺傳密切相關，有5%-10%的患者有明確遺傳病史。最主要與遺傳相關的結直腸腫瘤是FAP，稱為家族性腺瘤性息肉病，屬於嚴重的結直腸腫瘤，遺傳幾率較大。一般人體結腸內會有成百上千枚息肉，到一定年齡特別是40歲左右，癌變幾率幾乎100%。除FAP外，林奇綜合徵也是一種和遺傳密切相關的結直腸腫瘤。

如果家族中有人患結直腸腫瘤，特別是一級親屬，如父母、兄弟姐妹、子女是結直腸腫瘤好發人群，則本人發病率比普通人群高几倍甚至幾十倍。此類人群應該及早進行腸鏡篩查，以做到早期發現、早期治療。