如果胰腺尾部的假性囊腫或真性囊腫比較小，可以定期隨訪進行B超檢查，如發現沒有明顯增大，一般以保守治療為主，定期複查。如果囊腫逐漸增大，或囊腫壓迫到周圍組織，引起相應臨床症狀，可能需要微創引流治療，或進行清除手術。

胰腺尾部囊腫還有一個特殊類型，就是胰腺囊性腫瘤。胰腺囊性腫瘤分為很多類型，如漿液性囊腺瘤和神經內分泌腫瘤，除漿液性腫瘤很少惡變外，其它類型都會有低度惡性或潛在惡變可能性，所以一旦發現胰腺尾部囊腫，首先應該明確胰腺囊腫的性質，通過囊液分析或隨訪過程中有沒有增大，判斷生物學行為，再決定下一步治療。