先天性胰腺囊腫更多見於兒童和青少年，成人也會存在。一般先天性胰腺囊腫無需特殊處理，但存在幾種情況可能需治療，且治療大多數需通過外科手術才能達到治療效果，如下所示：

1、先天性囊腫引起症狀，包括壓迫症狀，或患者出現黃疸、進食困難等，需手術進行干預；

2、先天性囊腫在患者達到一定年齡時會發生癌變，當囊腫發生癌變需通過手術治療；

3、囊壁較厚或存在癌變風險的先天性囊腫可採取預防性手術治療措施，避免癌變發生。畢竟胰腺癌發生癌變後治癒率較低，因此可採取預防性手術治療措施。