胰腺囊腫的症狀有上腹隱痛、飽脹、噁心、嘔吐，囊腫增大時可有壓迫症狀，便秘、黃疸、腹水、下肢浮腫等。囊腫破裂入腹腔時有急性腹膜炎表現，破入消化道可形成內瘻並出現反覆高熱、腹痛，甚至上消化道出血。多數病人在上腹部可捫及圓形光滑包塊，合併感染時可有壓痛。

胰腺假性囊腫的臨床表現特點，主要是根據急性或慢性胰腺炎所處的階段而定。急性囊腫時表現為發熱、上腹脹痛或壓痛、腫塊、腹脹、胃腸道功能紊亂等，嚴重的可出現多種併發症。慢性胰腺炎假性囊腫，多發生在慢性複發性胰腺炎的基礎上，當囊腫體積不很大，主要表現為慢性胰腺炎的症狀，如上腹部及腰部、腰背部痛，脂肪消化功能障礙、糖尿病等，脾臟大、上消化道出血是此病的特徵。