腦膜炎臨床常見發熱、頭痛、頭暈、嗜睡、意識不清、脖子硬等症狀，應首先通過腦脊液檢查確定感染腦膜炎的原因，採用相應的針對性治療。

病毒性腦膜炎通過腦脊液的病毒培養，區分引起腦膜炎的病毒類型，進行抗病毒治療，一般採用更昔洛韋、阿昔洛韋、伐昔洛韋等抗病毒的藥物。同時進行預防脫水、退燒藥降溫、止痛劑減輕疼痛等針對性治療。

化膿性腦膜炎應儘早給予抗菌素和其他輔助治療，抗菌藥物選用對病原體敏感且容易透過血-腦屏障的抗菌藥物。

結核性腦膜炎一般採用異煙肼、利福平、鏈黴素、乙胺丁醇等抗結核藥物進行治療。

真菌性腦膜炎首先採用兩性黴素B，其次可採用氟康唑、咪康唑、伊曲康唑等抗真菌藥物治療。