肝吸蟲病根據患者體重計算服用吡喹酮的量，由醫生根據體重評估，計算需服用總量，通常該量分成2-3天服用，必要時次月可再進行重複治療。因部分患者會出現胃腸道、心臟、神經系統副作用，通常嚴重的患者需住院，若病情較輕在家服藥，治療期間需有人陪同；無家人陪同情況下，建議住院治療；有肝腎疾病或精神症狀的患者，服藥期間需嚴密監測。此外，該藥孕婦禁用，產婦哺乳期間服用藥物，禁哺乳。