檢驗嬰兒是否有腦膜炎通常需要做腦脊液穿刺檢查看腦脊液的壓力是否有增高，腦脊液的細胞數、蛋白質、糖的改變來區分是否有腦膜炎和是哪一類型的腦膜炎。也需要同時做炎性指標的篩查，比如血常規、C反應蛋白、降鈣素原等等來考慮炎性是病毒還是細菌、其它感染引起。還有需要做影像學的檢測，考慮有腦膜炎通常選擇頭部磁共振增強檢查，對於診斷腦膜炎的特異性和敏感性都是比較高的，腦電圖的檢查發現慢波增多通常也提示可能有腦膜炎。

所有的實驗室檢查、影像學檢查等等都是供臨床參考用，還是要注意臨床症狀、體徵，通嬰兒的腦膜炎會有精神差、不同程度的發燒、頸部抵抗感、腦膜刺激徵明顯、不同程度嘔吐等，特別是噴射性嘔吐的情況。