兒童膽總管擴張病因有以下幾種：

1、成人膽總管擴張原因最多見為腫瘤和結石，但兒童時期膽總管擴張主要原因則為先天性發育畸形，其中胰膽合流異常尤為常見，因正常情況下膽管跟胰管是在十二指腸乳頭裡會合，如果兩者在十二指腸壁外匯合，則會出現共同管長度過長，或者是匯合角度過於垂直，從而造成胰膽合流一段出現梗阻，後續會發生上段膽總管擴張；

2、兒童時期膽管結石、膽囊結石堵塞下面管道，也會造成膽總管擴張情況；

3、膽管壁發育異常、失去彈性，也會造成膽總管擴張；

4、膽道病毒感染，也會造成膽管壁破壞，引起膽管擴張。