一旦確診為生殖細胞瘤，即需開始治療，一般先進行化療。單純生殖細胞腫瘤基本先給予2-4個療程的化療，再進行全腦室加局部病灶的放療。如果是4個療程的化療，通常以21-28天作為一個週期，所以放療需要4-5周。

如果為混合性生殖細胞腫瘤，儘量先手術，後化療，再放療。此時化療一般需要6個療程，放療劑量可能更高。根據混合生殖細胞腫瘤的不同類型，更多會採用全顱、全脊髓放療加上局部放療，整個混合生殖細胞腫瘤放療基本要在6周左右。