生殖細胞腫瘤按WHO病理分型分為六個亞型，包括生殖細胞瘤、畸胎瘤、內胚竇瘤、絨毛膜上皮癌簡稱絨癌、胚胎癌、混合性生殖細胞瘤。良性腫瘤除了畸胎瘤之外，其他都是惡性。

除生殖細胞瘤外，腫瘤總稱為非生殖細胞性生殖細胞腫瘤，都可以經過腦脊液播散到全身或者轉移，生殖細胞瘤比非生殖細胞性的腫瘤生存率要高。

畸胎瘤可以經過手術達到徹底治癒，不需要術後放療和化療。惡性腫瘤要經過手術後放療、化療，而且要綜合性的治療才能提高生存率和延長生命。