腦幹損傷有兩種，即原發性的腦幹損傷和繼發性腦幹損傷。原發性腦幹損傷即患者創傷的過程直接損傷到腦幹。繼發性腦幹損傷，大部分是由於損傷其他部分損傷影響到腦幹，叫繼發性顱腦損傷。繼發性顱腦損傷的處理上，主要還是積極處理原發問題，包括保護神經功能。另外，全身治療加上後期的康復治療，其過程較為複雜，治療時間也比較長，包括後期高壓氧治療，前期神經營養、氣管切開、肺部感染等治療。

後期的康復訓練、高氧治療的治療週期相對比較長，因此比較兇險。腦幹損傷在上世紀90年代的死亡率較高，大概在了50％-60％。隨著醫療科學技術的發展，腦幹損傷後若能夠保持患者的呼吸道通暢，並且及時送醫，部分患者在治療後能夠得到好結局。