一般輕、中度腎積水在定期隨訪過程中腎功能變化較小。輕度腎積水可能在隨訪過程中積水程度越來越輕，最後積水消失。對於重度腎積水，在隨訪過程中如果腎積水加重，腎臟功能會越來越差，嚴重者可能功能喪失。

臨床上有時會見到部分患者之前沒有做過隨訪，突然發現腹部大包塊或者明顯腹痛，檢查會發現腎臟積水特別嚴重，腎臟實質、功能很差，皮質非常薄，這種腎臟可能已經沒有功能。雙側嚴重腎積水會導致腎功能衰竭，但這種嚴重情況在臨床上較少見。