如果腎臟積水已經引起腎臟實質萎縮，甚至出現腎功能損害，此時應判斷腎臟功能是否存在保留價值，需要進行同位素分腎功能檢查。如果仍具有腎功能，需積極針對積水原因進行排查分析，具體如下：

1、結石：針對結石進行體外衝擊波碎石，或者進行內窺鏡下激光碎石手術；

2、輸尿管狹窄：需進行腹腔鏡下狹窄段切除手術；

3、輸尿管腫瘤：需連同腎臟及全側輸尿管，進行完整的根治性切除手術；

4、輸尿管周圍病變：比如腹膜後腫瘤佔位性病變，此時需對輸尿管周圍的腫瘤進行手術切除。如果不能手術切除，則應考慮留置輸尿管內支架管，儘可能地引流腎積水，以最大限度保護腎臟功能。