目前還沒有任何一種的方法或者藥物，能夠促進房間隔缺損的癒合。但是房間隔缺損也確實有些會發生自愈，尤其是比較小的房間隔缺損，直徑小於5mm的，在孩子出生之後半年到一年之內，有可能會發生閉合。這種情況大多發生在單純的卵圓孔未閉，自我癒合的概率會更高。

而如果房間隔缺損過大或者是已經超過一歲，房間隔缺損依然沒有癒合，癒合的概率就非常低了。一般情況下是不會自我癒合的，需要進行手術治療。當然，如果是非常小的房間隔缺損，對心臟結構、肺動脈壓力、心臟功能都沒有任何的影響，病人也沒有任何的症狀，就可以不用治療。