房間隔缺損介入的手術時間需要根據每個病患病情來決定，病情不同手術時間也略有差別，一般大部分的房間隔缺損介入手術時間在0.5-2.5小時之間。具體要看患者的病情嚴重與否，手術之前要做術前的患者評估，比如心臟彩超和心電圖，用來評估患者的病情。

手術進行時先進行大動脈穿刺，把導管送進右心房，胸片幫助下在缺損的地方補上人工補片。如果封堵之後沒有出現心房血液分流，手術就算完成，可以把導管拿出來，這種手術對患者的損傷相對比較小，而且預後也會比較快。