低分化肺腺癌惡性程度很高，治療上首先應該明確是否有靶向治療的機會，應對患者進行基因檢測，針對肺癌靶向治療的基因主要為EGFR基因和ALK基因。

如果EGFR基因陽性，可以選擇吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼、阿法替尼、阿美替尼或伏美替尼等靶向治療，一線治療耐藥後病情進展，如果基因檢測發現出現T790m突變，也可以選擇三代奧希替尼進行治療。

如果ALK基因陽性可以選擇克唑替尼、阿來替尼或恩沙替尼，同樣，耐藥後也可以選擇三代勞拉替尼進行靶向治療。如果基因檢測後提示沒有基因突變可以進行化療，一線的化療方案可以為紫杉醇、多西他賽、吉西他濱等化療藥物聯合鉑類進行化療。