小孩子肛裂屬於常見病和多發病，使用的藥物包括痔瘡膏，可以選擇馬應龍麝香痔瘡膏、複方角菜酸酯乳膏，也可以使用抗生素類藥膏，比如金黴素眼膏或者紅黴素軟膏等等。

但由於小孩子肛裂大多是由於便秘、糞便乾燥、便線粗而硬，在排出肛門的過程中將肛管皮膚撐裂所導致，所以在使用藥物的治療期間，父母親應讓小孩子多吃蔬菜、水果、穀類等粗纖維食物，要多飲水刻意幫助其養成良好排便習慣，使大便保持軟化和通暢防止便秘，這樣才能促進肛裂裂口的癒合。