肛裂手術的難度並不大，在肛腸科手術裡面肛裂的手術相對比較簡單。需要行手術治療的大多為陳舊性肛裂，其裂口已經形成慢性潰瘍，裂口周圍由於慢性的炎症刺激而導致纖維增生、瘢痕化，外側會有哨兵痔形成，而肛裂裂口內側會有肛乳頭肥大，甚至肛乳頭瘤。

手術時需要將肛裂的慢性潰瘍裂口以及其附屬物，比如哨兵痔和肛乳頭肥大一併切除，並且需要在肛門側位切斷部分肛門內括約肌，鬆解肛管，降低肛管內壓力，防止肛裂復發。