孕酮低不孕，大致包括兩個方面。一方面是女性懷不上孩子，不能懷孕，伴有孕酮低，一方面是女性可以受精，但是不能正常懷孕到足月生產，每次懷孕都孕酮低，之後出現胚胎停育、流產，這兩種要區別對待。

一、孕酮低不能懷孕：

對於孕酮低不能懷孕，一般臨床上考慮黃體功能不全，一方面影響卵細胞質量，另一方面影響受精卵著床。黃體功能不全，通常會影響排卵，可能會有卵泡發育不良、成熟度不好或排卵障礙，無法排出卵細胞，這些原因都會影響精子、卵子結合。如果無法正常受精，就會導致女性不孕。卵巢在排卵之後會形成黃體，黃體分泌雌孕激素增厚子宮內膜。如果黃體功能不全，子宮內膜較薄，就不利於胚胎的著床，有時就會導致不孕。

如果檢查判斷沒有其他婦科炎症，也沒有其他內分泌疾病，可以給予黃體期補充孕激素治療，通過這樣的治療，一部分女性可以獲得受孕能力。

二、懷孕後孕酮低：

有時女性可以懷孕，但是每次懷孕都會出現孕酮低，之後出現胚胎停育、流產，稱之為習慣性流產。習慣性流產要查找原因給予處理，有時是胚胎自身質量的原因，有時與父母雙方染色體異常相關，有時與媽媽的自身免疫性疾病或者卵巢功能不全相關。

如果是胚胎質量問題，只能再次妊娠，因為有時胚胎質量不好，就會造成流產。如果是父母雙方染色體異常導致，建議再次妊娠時可以採取三代試管嬰兒，挑選染色體正常的胚胎種植，就可以改善妊娠結局。

如果與媽媽卵巢黃體功能不全相關，就會表現為孕激素較低，孕酮也偏低，懷孕之後可以大量補充孕激素保胎治療。如果與抗磷脂綜合徵等自身免疫性疾病相關，抗磷脂綜合徵會造成胚胎有微血栓形成，常常就會導致孕酮低，最終造成胚胎停育，通常在下次妊娠後要給予抗凝治療。