小兒房間隔缺損5mm不嚴重，通常認為房間隔缺損≤5mm的情況屬於小型房間隔缺損。但新生兒心臟較小，因而標準相對而言也需調整為3mm。小兒房間隔缺損中以二孔型房間隔缺損最為常見，約佔分型的75%，但在整個兒童期通常不會危及生命。嬰兒時期左右心室充盈阻力相等且分流較小，因此臨床上較少會出現相應症狀，僅在左向右分流量大時才會出現症狀表現。

多數房間隔缺損的小兒生活質量較好且與正常兒童基本無異，僅在30-45歲後才會出現異常表現。小兒房間隔缺損多在體檢時發現心臟存在雜音，到醫院檢查方才明確患有先天性心臟病。對於＜5mm的房間隔缺損，4歲以內的小兒有15%自發閉合率，因此影響不大，可以平安度過整個兒童期。