嬰兒的房間隔缺損可以自愈，部分嬰兒的房間隔缺損隨著定期追蹤、隨訪、觀察，房間隔缺損可以逐步縮小，甚至達到自愈的目的，後期可以避免手術治療。但是部分嬰兒的房間隔缺損，隨著時間推移，發現並沒有進一步自愈。如果房間隔缺損直徑＞5mm，並且已經定期觀察1年或2年，年齡已經達到3歲以上，則後期自愈的可能性非常小。

建議可以採用先天性心臟病介入療法或者先心外科的手術修補方法，個別嬰兒的房間隔缺損，隨著時間推移並沒有自愈，但是缺損直徑較小，缺損直徑＜5mm。這時可以暫時不需要進一步手術治療，但是需要進一步追蹤、隨訪，並適當延長隨訪時間。如果房間隔缺損範圍仍小於5mm，則不再需要進行手術，或者進一步干預，定期隨訪即可。