房間隔缺損自愈可能性比較大。如果房間隔缺損不是很大，而且小時候影響不大，可以臨床觀察。房間隔缺損自愈主要是周圍正常房間隔組織，向缺損地方逐漸收攏、癒合。一旦癒合之後，房間隔缺損復發可能性幾乎很小，因為房間隔缺損兩邊壓力差並不大。

所以房間隔缺損修復之後，即使剛開始其形成新的房間隔組織比較薄，但是兩邊壓力相對比較平衡，所承受壓力比較小。只要房間隔左右兩邊血流不通，即自愈。房間隔缺損自愈之後對心臟影響幾乎消除，所以自愈是房間隔缺損最好治療方法。